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11月25日晚，中国证监会与香港证监会发布联合公告，深港通下的股票交易将于2016年12月5日开始。
前海开源首席经济学家杨德龙表示，深港通开通的意义并不在于能给市场带来多大的增量资金，而在于对A股市场投资理念的改变。在A股市场里，蓝筹股的估值长期处于低位，小盘股的估值反而高。在港股市场里的情况正好相反，市场里的蓝筹股具有比较高的溢价，而小盘股存在比较大的折价。深港通一旦开通，与此前已经开通的沪港通一起，将使A股实现全面的互通互投。这就有利于缩小A股与港股之间的估值差距，A股蓝筹股的估值就有望提升，小盘股的估值可能会受到压制。因此，杨德龙坚定看好蓝筹股。
他认为，与沪港通相比，深港通的开通放出大量的小盘股标的。投资者可以买入港股里一些50亿港币以上市值的小盘股，由于这类企业的业务应该和内地创业板的类似，但估值比较低，有些不到10倍，所以深港通开通后，部分资金可能会进入香港市场去买这样的成长股。因为这些股票是A股比较稀缺的，所以它们也是投资港股的一个机会。此外，港股里如博彩等行业国内没有，这也是值得投资者关注的。
而前海开源基金执行投资总监、国际业务负责人曲扬认为，短期来看，港股市场依旧将受到海外众多不确定性因素的持续影响。从中长期角度看，“互联互通”的持续发展将得益于其独特的模式，其核心在于交易过境、清算不过境。这种独具创新的交易模式将有效扩充国内投资者投资海外的渠道，同时也吸引海外投资者更方便的投资中国市场。
曲扬表示，“深港通”的开放，将进一步扩大港股中小市值公司投资标的，纳入了更多代表创新力量的优质中小型企业，我们对港股市场中长期依旧持乐观态度。从全球横向比较，港股市场估值与全球主要市场相比仍处于相对低位，估值洼地使得港股向下风险较小，优势明显。
另外，曲阳认为，港元与美元挂钩，美元则可以作为规避资产贬值的“安全岛”，未来南下资金意愿的增加有望进一步带动港股市场整体流动性的提升。从投资范围来看，恒生中小型指数成分股的纳入将带动相关资金进一步关注在港上市的中小型创新型企业。“预计未来，将有相当一批前期相对缺乏流动性，估值折让较多的公司有望得到估值重估，高科技产业、产业、稀缺产业以及其他细分产业的龙头公司将率先得到市场关注。”曲扬表示。
广发基金国际业务部基金经理余昊告诉记者，无总额上限的深港通铺平了内地投资者投资港股的高速公路，两地市场的估值差异有望进一步缩窄。深港通将在沪港通港股标的中增加约百只中小市值标的，这部分标的与A股对应公司的估值差距较沪港通更大，其中不乏一些非常符合内地投资者偏好的标的，2017年有望出现显著的超额收益。
“我们认为短期市场对深港通预期较为充分，但中长期港股通改变了港股市场的国家定位，从中国企业的融资平台，上升为中国投资者的投资平台。我们观察到近期AH溢价大幅收窄，同时屡次出现A股上市公司并购港股低估值上市公司的例子，在各路逐利资本的作用下，港股有望迎来明年较大的超额收益行情。”余昊表示。
对于港股后市，余昊表示，看好明年港股中型市值行业龙头的价值发现机会。“从基本面和资金面上看：中国经济小阳春，企业盈利有望超预期；内地资金在人民币贬值的压力下持续流入港股，大幅超过了外资流入或者流出的体量，在基本面超预期和资金面净流入的双重支持下，港股有望成为17年资产配置的大赢家。”余昊说。
和存资产投资总监张文思告诉记者，“现在美元升值、美国债利率大涨，对国际市场资金面影响很大，港股市场可能受此影响更大。但在深港通开通前，国家队可能还是会在A股继续维稳，因此如果环球股市不大跌的话，那港股可能就在目前范围震荡。”张文思看好黄金股。
而格雷资产总经理张可兴向记者表示，不会因为深港通开通而加仓港股。“尽管大家认为港股整体估值远比A股低，但目前来看，实际上港股真正的好公司也不便宜了，我们投资港股现在不投指数类，主要是看个股。”张可兴表示。