根据蓝皮书的解释，所谓“上海自贸区发展陷阱”，其含义是上海自贸区设立在先，很多中央的金融开放改革的配套政策及措施还未到位，上海方面被动等待；此时，传统体制机制的东西却乘虚而入，从区外延伸到了区内扎根，形成了某种定势。

　　而一旦新的开放区域成立，较全面的国家政策措施基本落地时，将出现后来者居上的局面。这时，上海自贸区一时难以改变先前形成的“定势”而陷入发展滞后的陷阱。

　　研究者认为，新申请的自贸区形成的竞争态势、上海自贸区发展显现出的“瓶颈”等问题已经使上海自贸区有落入“上海自贸区发展陷阱”的现实可能。

　　其认为，从其他地区目前已经透露的设计方案来看，在金融开放改革方面不少与世界市场接轨程度更高，在贯彻世界通行规则上更具体。而上海目前基本上处于“等靠要”的状态，上海自贸区应发挥新功能以应对发展“陷阱”。

　　上海自贸区自成立以来，外界一直有声音质疑其开放和创新力度，而此前高层对自贸区的调研以及对上海的区域定位也给上海自贸区的创新带来更大的机遇和挑战。

　　上海对外经贸大学教授赵红军认为，随着上海自贸区的制度创新，长三角经济一体化的趋势也将逐步加强。这将有赖于上海自贸区内的管理制度在整个长三角范围的模仿和示范效应以及目前长三角各省市之间的经济互补关系。

　　此前举行的长三角城市经济协调会第14次市场联席会议上，上海市政府合作交流办副主任、长三角城市经济协调会办公室主任姚新表示，未来将充分利用邻近自贸区的区位优势，主动加强基础设施、产业融合、平台建设等方面合作，使长三角地区率先成为自贸区的直接受益者。

　　除了对内的拉动，上海自贸区还承担着对外应对新一轮自由贸易谈判的重任，这其中，将对自贸区内的政府治理模式、本土企业的发展、知识产权保护等领域提出挑战。

　　蓝皮书以文化产业为例指出，外资文化企业的强势入驻有可能冲击本土文化发展，而对文化产业的不断开放也有可能影响文化产业的创新。

　　而由于上海自贸区的制度完善需要一定时间，知识产权保护制度还不够完善，自贸区内有可能出现通过恶意抢注而取得专利的“专利投机人”类型的企业。因此，研究者建议上海自贸区文化产业要形成聚集发展的模式，并且完善以知识产权为核心的安全保障制度。