其中，投入最大的试验发展经费去年共累计达到5844.3亿元，占总投入的82.7%，增长21.7%。而代表原创性研究的基础研究和应用研究经费则各为324.5亿元和893.8亿元，分别增长20.1%和22.3%。对此科技部表示，数据显示原创性研究投入占总科研经费投入比重连续三年保持稳定，达到17.2%。

　　虽然科技投入强度较上年有所增长，但《公报》显示，全国各地对科研的投入力度差异仍然较大，全国科研投入占GDP比重排名最高的北京达到了5.82%，去年共投入821.8亿元。除北京外，上海、天津、陕西、江苏、浙江和广东6省市投入强度亦在平均水平之上。投入最多的前六省市占全国经费投入总量的比重已经接近六成。

　　而余下有24个省市的科研投入强度在平均线以下，其中14个省区科技投入占GDP比重不足1%，最低的西藏、海南等比重仅为千分之二三，还不到北京投入比重的十分之一。

　　根据《公报》显示，各类企业去年投入科研经费共5185.5亿元，增长22.1%，占总投入比重达到73.4%。高校科研经费投入实现增速最快，达到了27.6%，政府属研究机构投入和高等学校投入的合计比重仍然还占不到三成。

　　而去年各行业科研投入强度来看，专用设备制造业的投入比重名列第一，紧随其后的是投入比重达到1.82%的医药制造业，其余如通用设备、电器机械及器材和仪器仪表等制造业的科研投入强度也在1.5%以上。

　　《公报》显示，全国各类科技投入中，财政投入仍是大头。2010年财政科技支出额达到4114.4亿元，占总投入比重达58.2%。其中中央投入2046.4亿元，地方投入首次超过中央，达到2068亿元。

　　而统计局的统计资料表明，2010年全国共安排科技支撑计划课题326项，863计划课题308项，分别为2009年安排同类项目的一半和四分之一，同时其他各项科研工作的完成规模较2009年比，亦没有明显增长，而全年科研经费却仍然较2009年增长两成。

　　财政科技投入增长本应值得鼓励。但相关科研机构人士表示，科研经费目前已经成为了各项财政开支里面最说不清的一笔账。

　　国家发改委产业经济研究室主任史炜对记者表示，此前不乏地方政府坦承目前科研经费已经成为地方财政敛财的一个主要渠道之一。由于科研经费不进入一般预算盘子而由专项转移支付拨付，同时亦缺乏有力而透明的经费使用监督和绩效评价的机制，各地政府往往在加把劲“跑部钱进”获得科研经费后，钱一到手就进入地方财政，导致其中真正用于科研的比重有多大已难以估量。

　　而记者了解到，今年修订的科研经费管理办法，更疑似扩大了科研经费中的灰色空间。

　　财政部、科技部等部委近日发布《关于调整国家科技计划和公益性行业科研专项经费管理办法若干规定的通知》，对原有科研经费管理办法作出修改，其中主要是把科研经费分为直接费用和间接费用两类，其中直接费用为研究过程中直接相关的开支，而其他在课题过程中无法在直接费用中列支的相关费用，包括仪器设备及房屋，水、电、气、暖消耗、管理费用补助支出以及绩效支出等“无法分类”的支出，则都包括在间接支出中。

　　记者了解到，原有管理办法中对于间接支出统称为管理费，对其实行总额控制，适用分段超额累进核定法，如原《国家重点基础研究发展计划专项经费管理办法》则规定，总经费预算100万元以下按照8%核定管理费，100万-500万元间部分核定比例则为5%，500万-1000万元间为2%，超过一千万的部分则按照1%进行核定。

　　而此次调整后，则修改了间接费用的核定比例，规定课题经费中直接费用扣除设备购置费后，间接费用的核定比例为500万元及以下部分不超过20%，500万-1000万元的部分不超过13%，大于1000万元的部分则不超过10%。

　　上述科研机构人士表示，这次新的调整虽然基数有变化，但总体来说还是调高了间接费用的核定比例，“间接费用本身管理就相对严谨性较差，加大比重可能更加不利于经费的监督管理。”