这种股权分置的长期存在，对中国上市公司造成的后果是大股东与小股东无法达成利益的一致。大股东由于股权不能流通，因此对股票在二级市场上的表现毫不关心，只是热衷于利用其对上市公司的控股权将上市公司的资产转移到自己手中，一段时间里，几乎每一个由国有资本控股的上市公司都发生了大股东占用上市公司募股资金的违规现象，严重的如三九医药占用率高达90%以上。

　　面对萎靡不振的股市，面对上市公司治理中出现的乱象，市场终于逐渐形成了一个共识，中国资本市场需要动大手术，解决股权分置问题，要让以国有股为代表的控股股东的股权能够流动起来，体现其股权价值。但是，一旦大股东获得流通权，就意味着市场流通规模迅速扩大，这对二级市场的股价必将形成巨大打压，因此需要大股东作出一定的牺牲，给原有的流通股股东以利益补偿，这就是支付对价，一个上市公司要获得股份全流通权，其控股大股东必须向流通股股东支付对价。

　　2005年4月29日，证监会发布了《关于上市公司股权分置改革试点的通知》，困扰中国资本市场长达15年之久的制度性缺陷开始全面启动改革程序。5月9日，第一批4家试点公司推出，当天沪深两地指数分别大跌2.44%和3.97%。市场出现这种情况是不奇怪的，因为股改的启动意味着股市流通规模的扩大，意味着国有股可以上市抛售。面对来自市场的压力，证监会主席尚福林在一个座谈会上放出豪言：“开弓没有回头箭！”

　　2006年6月，经过一年多的实践，大多数公司已顺利完成了股改，中国证监会决定重新启动新股发行，全流通后第一股中工国际（002051）推向市场，市场迅速出现“炒新”狂潮。以此为起步，中国资本市场逐渐聚拢人气，推动沪深两市指数节节攀高，终于迎来了2007年一轮前所未有的大牛市。

　　从2005年开始的股权分置改革，至今已基本结束，现在，中国资本市场已经是一个全流通的市场。而市场出现的新格局，又向投资者和市场管理者提出了新的挑战。一方面，随着时间的推移，大量原来锁定的非流通股都开始获得流通权，这些被市场称为“大小非”的股权存量庞大，持股人抛售意愿强烈，对市场冲击很大，因此对市场行情的打压力度很大，管理部门在一段时间中不得不花费巨大精力来应对这个问题；另一方面，全流通以后，虽然大股东和小股东的利益在某种程度上达到了一致，但小股东的权利伸张仍然受到种种限制，大股东利用其控股权侵犯小股东利益的事情仍然屡有发生。

　　很显然，股改虽然完成了，但资本市场的发展总会暴露出各种新的问题，改革是未有止境的。