对市场参与者而言，熔断机制影响最大的莫过于公募基金。为此中国基金业协会在2015年12月15日也专门下发了《关于指数熔断机制实施后公募基金行业相关配套工作安排的通知》督促相关基金管理人、托管人及基金销售机构在指数熔断机制实施前做好相关配套工作。

　　因为熔断机制牵涉到公募基金配套系统的改造，早在熔断规则征询意见稿阶段，各家公募基金内部就已开始讨论和研究可能带来的影响。

　　华宝证券在分析协会通知后认为，由于熔断期间，如果不调整申购赎回，则公募基金份额可能面临巨额申赎，巨额申购导致对原份额持有人净值造成稀释或摊薄，巨额赎回造成未赎回的投资者承担赎回投资者的抛券风险。因此需要对申赎进行调整，协会要求公募基金公司在今年1月1日前对调整内容做出公告。

　　根据公募基金公司已发布的公告，此次调整对象为境内股票等权益品种的开放式基金和交易型开放式基金，因此债券、货币、黄金、商品、跨境等品种不受限制。而A股权益ETF、分级、A股权益LOF（包含主动和被动）、普通开放式股票和混合基金将为调整对象。

　　银河证券认为，指数熔断后，势必将影响公募基金的估值问题。指数熔断导致股票暂停交易，如果直接熔断到收盘，可能会导致部分股票收盘价失真。使得基金估值出现一定的困难，虽然基金管理人可以选择一个更好的公允价值来进行估值调整，而找到一个好的公允价值是非常困难的事情。部分公募基金会投资股指期货，而熔断后，股指期货的估值也有可能会出现失真，从而影响基金的估值。

　　“估值不当会出现很多问题，一是带来投资者异常申购赎回。”银河证券表示，比如估值偏低，则可能带来大量的申购，如果估值偏高，则可能带来大量的赎回。异常的申购赎回会影响部分基金持有人的利益，同时会增加公募基金的运作难度。另一个可能存在的问题是部分基金提取业绩报酬，而业绩报酬跟基金净值挂钩，而基金净值跟基金估值挂钩。如果提取业绩报酬计算的参考净值涉及到熔断发生日，则可能因出现基金估值不当而产生纠纷。

　　指数熔断会带来流动性短暂消失，这给基金仓位的管理带来一定的困难。为了应对赎回，公募基金会预留部分现金仓位。同时应对日常赎回，会进行卖股票的操作。“在极端情况下，如果持续的熔断，会让公募基金难以卖出股票来应对赎回。对于高仓位运作的指数基金而言，熔断机制带来的流动性问题更为突出。”银河证券认为，基金管理人有倾向保留更多的现金，但这样会降低公募基金的效率。

　　同时，银河证券也认为，如果当天指数跌幅较大，已经接近熔断阈值，基金管理人可能会处于流动性的考虑（担心熔断之后没法卖），而提前卖出股票，这样进一步带来对指数的冲击。其他投资者也可能会有这种动机。所以存在熔断机制下，公募基金管理人需要对更加重视仓位的管理，密切关注申购赎回情况和市场的情况，以防风险发生。